Тектонические структуры Алтая сформировали герцинская и каледонская складчатости. В строении Алтайских гор приняли участие протерозойские и главным образом палеозойские породы: метаморфические сланцы, слюдистые кварциты, амфиболиты, известняки, песчаники, алевролиты, глинистые сланцы, вулканогенные толщи. Осадочные и метаморфические породы прорваны гранитными и гранодиоритовыми интрузиями. Герцинские складчатые горные сооружения в континентальных условиях мезозоя и палеогена разрушились и превратились в денудационную мелкосопочную равнину. Поднятия в неоген-нижнечетвертичное время с максимальной амплитудой в центральных частях горной области сформировали ее современный рельеф. Сводовое поднятие сопровождалось поднятиями и опусканиями отдельных блоков.