В северной части Африки пустыни занимают большую площадь территории. Именно здесь расположенная самая крупная пустыня в мире – Сахара. Растительность на территории Сахары развита плохо: здесь встречаются растения, имеющие хорошо развитую механическую ткань и обладающие высокой засухоустойчивостью.
В Южной Сахаре встречаются злаковые растения, на севере пустыни распространены кустарники. В оазисах пустыни Сахары растут финиковые и кокосовые пальмы. На территории Южной Африки расположены две пустыни: Кару и Намиб.
Здесь распространены суккулентные растения, преимущественно алоэ и молочаи, а также кустарники акаций. На окраинах африканских пустынь расположены полупустыни, которые образовались в результате массовой вырубки лесов в саваннах. Для полупустынь типичны клубненосные и луковичные растения, а также ковыль.