В общем, ароморфоз - крупное преобразование организмов, повышающее общий уровень организации; идиодаптации - приспособление организмов к конкретным условиям среды. Думаю, на примерах более понятно будет.
У птиц в процессе ароморфоза появился клюв, идиоадаптацией здесь будет форма клюва. Появление перьевого покрова - ароморфоз, а окраска перьев - идиоадаптация. Ещё у млекопитающих, например, ароморфоз - появление шерстяного покрова, а идиоадаптация - распределение волосяного покрова по телу.
Лично я думаю, что общее между ароморфозом и идиоадаптацией - это появление систематических групп, классов, типов, но у ароморфоза они крупные, а у идиоадаптации мелкие.