Главное отличие - высота поверхности: с Запада находятся Анды, с востока же - Амазонская низменность.
Такое различие обуславливается расположением литосферных плит. Плита Наска (Тихий океан) в результате движения столкнулась с Южно-Американской плитой, которая в результате столкновения поднялась, образуя Анды.