Противопоказан беременным и кормящим женщинам, больным эпилепсией, серьёзным психическим заболеванием, бронхиальной астмой, стенокардией.
Не рекомендуется несение не разведённого сока чистотела на открытые раненые участки, так как может быть усиление воспалительной реакции окружающих тканей. При внутреннем применение возможен запор.