Если у вас логический размер файла составляет 1 байт, а размер кластера файловой системы - 4 Килобайта, то фактически будет занято 4 Килобайта.
Ёмкость самого физического диска увеличить невозможно. Можно только использовать те или иные способы сжатия информации. 2)Увеличив плотность или купив другой более емкий HDD.