У всех семенных растений в строении зародыша различают такие части: зародышевый корешок, зародышевый стебелек (гипокотиль), зародышевая почечка, одна или две семядоли (зародышевые листья). Ось зародыша включает зародышевый корешок и стебелек. К верхнему участку на стебельке присоединены семядоли. Та часть стебелька, которая расположена выше семядолей, называется эпикотилем, ниже - гипокотилем. На вершине стебелька находится почечка, являющаяся зачатком главного побега молодого растения. Из корешка впоследствии образуется главный корень нового растения.
У большинства зародышей эпикотиль и гипокотиль при прорастании семени удлиняются и выносят на поверхность грунта семядоли. Первым показывается именно гипокотиль, он выглядит как петелька, которая распрямляясь, поднимает семядоли и почечку.
Семядоли. Количество семядолей в семени отличается у разных видов растений. По этому признаку все цветковые растения разделены на два класса: однодольные с одной семядолей и двудольные с двумя, реже тремя или четырьмя. У голосеменных число семядолей различно - от двух до пятнадцати. Эти структурные элементы зародыша представляют собой первые листья, развивающиеся в семени на недифференцированном зародыше. Они обычно сильно отличаются от последующих листьев по многим признакам.
При прорастании семени под землей в семядолях хранится запас питательных веществ для зародыша. При выходе на поверхность стебелька с семядолями, семядоли приобретают зеленую окраску и способность к фотосинтезу, что также обеспечивает новый организм органическими веществами. У некоторых групп растений, например, у злаков, роль семядолей сводится к поглощению питательных веществ эндосперма и транспортировке их в надземную часть проростка. У других видов однодольных растений семядоля преобразовалась в специализированный орган, основной функцией которого является защита зародышевой почечки от повреждений. Он выглядит как колпачок, и при прорастании семени проросток пробивает почву прочной верхушкой.