Папоротники появились позже, у них более дифференцировано строение.
У папоротников появляются корни (придаточные) , у мхов корней нет.
Лист папоротника (вайя) имеет более крупные размеры и сложное строение листовой пластинки.
Есть плосковетка похожая на настоящую ветку с листьями
Взрослое листостебельное растение папоротника (спорофит) диплоидное, мхи - гаплоидные.
Могут жить в более сухих местах.