Возбудитель паразитирует под эпителиальным слоем кожи и жабр. Инвазионная вспышка ихтиофтириоза вызывает массовую гибель рыб в аквариумах. Возбудителем является одноклеточная равноресничная инфузория Ichthyophthirius multifiliis из класса Ciliata, семейства Ophtyoglenidae. Она имеет округлое или овальное тело величиной 0,1-1,0 мм. На переднем, слегка суженном конце находится очень маленькое ротовое отверстие, окруженное ресничками. Поверхность тела меридиально исчерчена ресничками, которые сходятся у ротового отверстия и являются средством передвижения инфузории. Посредине тела расположено крупное подковообразное ядро — макронуклеус, рядом с ним — маленький, плохо видимый микронуклеус. Внутри клетки разбросаны многочисленные сократительные вакуоли и темные мелкие включения, представляющие собой комочки пищи.
Размножаются инфузории путем многократного деления надвое вне организма рыбы. Зрелые формы - трофонты, локализующиеся под эпителием кожи, разрывают белый эпителиальный бугорок, выходят в воду и опускаются на дно, где прикрепляются к различным предметам (песку, гравию, камням, растениям и т. д.). Тут же происходит образование цисты, внутри которой начинается деление клетки. I. multifiliis очень плодовита. При многократном делении надвое из одного трофонта образуется до 2000 дочерних клеток, называемых «бродяжками», размеры которых колеблются от 30 до 50 мкм. «Бродяжки» растворяют цисту при помощи особого фермента и выходят в воду. При помощи ресничек они свободно плавают. Если в течение 2-3 суток «бродяжки» не попадают на рыбу, то они погибают. Попавшие на рыбу локализуются под эпителием кожи и жабр, где растут и созревают, после чего цикл развития повторяется. Оптимальная температура воды для развития паразита 25-26 ?С. Понижение температуры задерживает инцистирование, замедляет деление и рост паразита, удлиняет сроки жизни «бродяжек» вне организма рыбы. Слабое освещение также увеличивает срок жизни «бродяжек».
При повышении температуры воды до 32-34 °С ихтиофтириусы погибают через 4-6 часов. У переболевших итиофтириозом рыб вырабатывается относительный иммунитет, благодаря которому при повторном заражении болезнь протекает легче, чем в первый раз.