Слово "столъ" в древнерусском языке означало "престол", "княжение", "столица".
"Седети на столе" - быть государем.
Этимологические словари дают о слове "стол" следующую справку В древнерусском языке так называли покрытое чем-либо возвышение, на котором можно было и посидеть, и разложить еду или письменные принадлежности… Не случайно стол и стул так похожи по звучанию. Также не случайно, что у лексемы стол появилось значение «трон» (богато украшенное место сидения князя, а позже – царя, один из главных символов верховной власти в государстве) . Город, в котором находился стол великого князя, называли стольный град, а впоследствии – столица.
А для того чтобы главный стол страны отличать от других столов, было создано слово престол. При этом использована приставка пре - со значением высокой степени проявления признака (как в словах предобрый и преспокойно)