В природе моллюски входят в многочисленные цепи питания водных и наземных сред жизни. Обитающих в морских и пресных водоёмах моллюсков поедают: рыбы, птицы, кашалоты, моржи, тюлени, усатые киты и морские звёзды.Истинными охотниками на моллюсков являются: лещи, сазаны, караси, чёрный амур, вобла каспийская, камчатский краб и другие. Наземных лёгочных моллюсков (улиток) едят жабы и кроты, а также многие пресмыкающиеся и земноводные. У травяной лягушки они составляют существенную часть рациона. Улиток склёвывают: вороны, галки, фазаны, голуби. Личинками моллюсков охотно питаются многие водные животные.В водоёмах особенно велика роль двустворчатых моллюсков-фильтраторов. К фильтраторам относятся: беззубка, перловица и дрейссена речная. Они широко распространены в водоёмах Европы и Америки. Дрейссена выделяет липкие нити, позволяющие ей прикрепляться к подводным предметам, образуя массовые скопления — друзы.Личинки дрейссены могут оседать и образовывать обрастания на гидротехнических сооружениях, трубах турбин и защитных решётках. Такм образом личинки препятствуют нормальному течению воды. Очистка гидротехнических устройств представляет сложность и требует больших материальных затрат. В природных водоёмах дрейссена очищает воду, но подавляет развитие других двустворчатых моллюсков.Многие моллюски успешно используются человеком. Хорошо известны съедобные моллюски: устрицы, мидии, гребешки. В Японии добывают около 90 видов съедобных моллюсков.Существуют моллюски, которые наносят вред сельскому хозяйству. Виноградная улитка и различные слизни повреждают листья растений, плодовые тела грибов, корнеплоды и клубни на полях и в овощехранилищах. Многие прудовики являются промежуточными хозяевами червей сосальщиков.Камнеточцы сверлят камни и известняки. Корабельные черви повреждают дерево, нанося ущерб различным сооружениям. Хищный моллюск рапана опустошает устричные "банки", нанося значительный ущерб промыслу.