Одним из главных персонажей этого романа является Маша,дочь капитана Миронова.Роман написан от первого лица(которого зовут Петр Гринев).На службе и со знакомством со всей семьей капитана,и его окружением,он и заметил капитанскую дочку.После этого в романе часто упоминается,точнее почти имя девушки,отношение Гринева к ней и т.д.
То есть название "капитанская дочка" связана с героиней романа - Марии Мироновой,дочерью капитана