Цвет зависит от способности поглощать свет. Например, зеленые находятся ближе к верху, где возможен доступ света и как результат -фотосинтез.
Более глубокие слои воды дают возможность жить бурым, красным и так далее, у которых хлорофилл замещается на др. пигменты.