В сложносочиненном предложении все предложения самостоятельные, независимые др. от др.Можно поставить точку вместо запятой и смысл не измениться. Можно разделить еще каким -нибудь предложением.
Дождь шел, а солнце все равно светило. Дождь шел, тучи закрыли часть неба, а солнце все равно светило.
В сложноподчиненном одно предложение зависит от другого(подчиняеться). Нельзя их разделить не исказив смысла.
Дождь шел, когда светило солнце. Когда светило солнце- само по себе не имеет смысла, т. к. оно подчиненное 1-ому предложению(главному)