Дыхание делится на две части. Анаэробное дыхание останавливается на первой части и "сворачивает", Аэробное дыхание включает в себя вторую часть.
Анаэробы(Дрожжи) дышат без кислорода. В цитоплазме происходит гликолиз(распад глюкозы), в результате чего образуется пируват. Итог: две молекулы АТФ. Далее два варианта: молочная кислота и этиловый спирт.
Аэробы расщепляют пируват до углекислого газа и воды. Процесс сложный и он проводится в митохондриях(очень сложных органеллах с двойной мембраной и собственной белоксинтезирующей системой(!)) с участием кислорода. Профит значительный - 36 молекул аденозинтрифосфата.