Уравнение траектории - это аналитическое уравнение кривой, по которой движется тело (например, парабола, циклоида и др.).
Уравнение движения показывает зависимость перемещения от времени (или других физических величин).
Первое - аналитическое уравнение линии.
Второе - функциональная зависимость.