Главное отличие у прокариот нет ядра, кольцевая ДНК (кольцевая хромосома) расположена прямо в цитоплазме (этот участок цитоплазмы называется нуклеоид).
У эукариот есть оформленное ядро (наследственная информация [ДНК] отделена от цитоплазмы ядерной оболочкой.
Раз у прокариот нет ядра, то нет и митоза/мейоза. Бактерии размножаются делением надвое.
У прокариот из органоидов имеются только рибосомы, а у эукариот кроме рибосом имеется множество других органоидов: митохондрии, эндоплазматическая сеть, клеточный центр.
Клетка прокариот гораздо меньше клетки эукариот: по диаметру в 10 раз, по объему – в 1000 раз.