3) Не только члены нашего кружка были заинтересованы в проведении конференции, а также сам руководитель принимал активное участие в её организации.
Не только, но и - этот союз изменять нельзя + он соединяет однородные члены, а не части предложения!
Правильный вариант:
В проведении конференции были заинтересованы не только члены нашего кружка, но и сам руководитель.