Режими річок системи Міссісіпі досить різноманітні.Максимальний розлив річки припадає на березень-травень.Праві притоки Міссісіпі,витоки яких знаходяться в Скелястих горах,найвищий рівень мають навесні та влітку внаслідок злив і танення снігу,саметоді бувають сильні повені.Взимку вони на кілька місяців вкриті льодом.А ліві притоки повноводні майже весь рік,але особливо під час літніх мусонних дощів.У нихній течії річка ніколи не замерзає.