В роли объединителя этих разрозненных земель выступил воинственный завоеватель Амир Темур (Тамерлан) . В 1363 он завладел Самаркандом, который впоследствии превратил в столицу своей огромной империи. В 1370 году Амир Темур был признан верховным правителем Маверннахра. В 1388 году Амир Темур разорил богатый хорезмский город Ургенч – крупный пункт на Шелковом Пути, а затем и столицу Золотой Орды город Сарай Берке. Теперь все караванные пути проходили через города Мавераннахра – Отрар на юге Казахстана, Балх, Ташкент, Герат, Султанию (Иран) . В средневековье столица Амира Темура – Самарканд – была призвана стать самым красивым городом на земле. Лучшие зодчие создавали новые и новые шедевры архитектуры средневековья: дворцы, мечети, мавзолеи, которые до сих пор поражают воображение красотой и размахом.
Во 2-ой половине XIV века Темур начал военную кампанию против других государств, подчинив себе огромные земли: с востока на запад - от Черного моря до реки Ганг, а с севера на юг – от Аральского моря до Аравийского.
Государство, созданное Амиром Темуром, после его смерти в 1405 стало рушиться на глазах. Сын Темура - Шахрух – сумел сохранить земли Хорасана, Афганистана и Мавераннахра. Он сделал своей столицей Герат, а в Самарканде оставил править своего сына Улугбека. В 1447 после смерти Шахруха Улугбек стал во главе правящей династии, но в 1449 был коварно убит своим сыном Абдулатифом. Правление Темура и его наследников – Шахруха, Улугбека и Бабура, ознаменовалось развитием искусства, ремесла, торговли, расцветом литературы, науки. В Герате в это время творил известный поэт и государственный деятель Алишер Навои.