Ответ:
Можно сколько угодно предполагать, какой животное могло стать прототипом известного Ученого Кота, но это будут лишь предположения.
В произведении "У Лукоморья дуб зеленый" нет ни слова о кличке этого кота. Возможно лишь что все нарицательное выражение "Кот ученый" и есть его кличка, а слово ученый не выступает здесь оценкой его знаний.