Связь с атмосферой проявляется в процессе фотосинтеза и дыхания живых организмов. Именно организмы формируют газовый состав атмосферы.
Взаимодействие с гидросферой заключается в жизнедеятельности любых водных организмов, которые непосредственно влияют на состав воды. Установлено, что в последние два столетия солёность воды снизилась. Это объясняется тем, что организмы используют кальций в процессе своей жизнедеятельности. Они «строят» из него ракушки или панцири.
Связь с литосферой проявляется в росте деревьев и растений, которые своими корнями держатся за землю, подчас разрушая породу. А остатки живых организмов накапливаются в толще земли и на дне озёр. Так формируется торф и уголь.