Эвглена зелёная — типичный растительный жгутиконосец, имеет зелёное веретеновидное, длинноетело, задний конец которого обычно заострён, на переднем тупом конце расположен жгутик. У переднего конца имеется красный глазок (светочувствительный органоид, стигма).