Воды Москвы-реки широко используются для водоснабжения города.Москва-река с древности была важной транспортной магистралью. Водные пути связывали её с Новгородом и Смоленском, Волгой и Доном.
Сейчас река судоходна на 200 км от устья до Рублёвской плотины.