Слово "синяя" - это прилагательное женского рода, которое отвечает на вопрос "какая?". Например, синяя птица. Если разобрать это слово по составу, то мы получаем следующее: -син- корень, -яя- это окончание женского рода прилагательных в именительном падеже. Окончания -ия- здесь просто быть не может.