Найбільше значення мають нитрифицирующие бактерії, що окислюють аміак до азотистої, а потім до азотної кислоти: Залізобактерій перетворюють закисное заліза в окисне: серобактериями окислюють сірководень до сірки або сірчаної кислоти: В результаті окислення виділяється енергія, яка запасається бактеріями у вигляді АТФ.