Одним из крупнейших географических достижений Юнкера было то, что он фиксировал положение водораздела Нил - Конго почти на всем его протяжении (около 1200 километров). Если учесть, что эта гидрографическая граница была до этого нанесена на карту на небольшом участке - там, где ее пересекал Швейнфурт в 1870 году, - можно сказать, что водораздел Нил - Конго был открыт Юнкером.