В первых двух примерах запятые проставлены верно. 3. Пастер, знаменитый учёный,.... 4. С моря поднималась туча, чёрная и тяжёлая. 5. Скажи мне, кудесник, (обращение) любимец богов, что сбудется.... 6. Верно.
Обособленные определения:1,4,6
Обособленные приложения :2,3, 5