в данных строках слово тяготит означает мучения за содеянное. автор используя прием олицетворения повествует читателю о том, что тучи бегут от совершенного ими преступления, в надежде избавиться от мучений совести.
в жизни тяготит имеет множество значений, например, вес - ноша тяготит
снег тяготит кровлю