Мышцы
Глубже ресничного эпителия залегают мышечные волокна, расположенные поперёк тела червя. При сокращении поперечных мышц червь становится более узким и длинным. Под поперечными находятся продольные мышечные волокна, соединяющие спинную и брюшную стороны тела.
Под поперечными и продольными мышечными волокнами находится рыхлая масса мелких клеток — паренхима. Она заполняет промежутки между внутренними органами. Мышцы и паренхима образуются из третьего (промежуточного) зародышевого слоя клеток.
Пищеварительная система
Планария — хищник, она нападает на мелких животных, например рачков и червей. Особые, разбухающие в воде выделения некоторых клеток эпителия помогают ей удерживать добычу. Планария прижимается к пойманной жертве, а затем при помощи выдвижной глотки заглатывает её.
Большинство свободноживущих плоских червей имеют разветвлённый кишечник, открывающийся наружу ротовым отверстием.
Стенки кишечника состоят из одного слоя клеток, которые захватывают проглоченные частички пищи и переваривают их. Питательные вещества проникают затем во все остальные клетки тела, а непереваренные остатки пищи поступают из клеток в полость кишечника и удаляются наружу через рот.
Переваривание пищи происходит и в кишечной полости под влиянием пищеварительных соков, выделяемых железистыми клетками кишечника.
Дыхание
Свободноживущие плоские черви дышат кислородом, растворённым в воде. Поступление кислорода в организм и удаление углекислого газа происходит через кожу.
Плоское тело планарии с большой поверхностью способствует лучшему газообмену в организме.
Выделительная система
Органами выделения служат разветвлённые трубочки (канальцы), пронизывающие тело червя.
Они начинаются в паренхиме клетками звездчатой формы. В каждой клетке имеется пучок длинных ресничек, которые постоянно колеблются. Их называют «пламенными клетками», потому что движение ресничек напоминает язычок колеблющего пламени. Колебание ресничек создаёт ток жидкости в трубочках
Трубочки сливаются в два продольных канала, которые открываются наружу несколькими отверстиями (порами) на спинной стороне тела. Жидкость, которая выводится из организма, состоит из водного раствора вредных продуктов, образующихся в теле планарии.
Нервная система
Нервная система свободноживущих плоских червей состоит из скоплений нервных клеток — парных головных узлов, нервных стволов и многочисленных нервных ответвлений. От нервных стволов ко всем органам отходят многочисленные органы.
Органы чувств
Хорошо развиты органы осязания — чувствительные клетки, расположенные на поверхности тела. Особые органы осязания — парные щупальца расположены на переднем конце тела. Рядом с ними находятся глаза, с их помощью планария различает уровень освещённости. Имеется орган равновесия.