Гипоталамус является частью промежуточного мозга. Он образует основание и стены нижней части третьего желудочка.
Таламус выполняет несколько важных физиологических функций. Он отвечает за передачу сенсорной и двигательной информации от органов чувств (кроме информации от органов обоняния) к соответствующим областям коры больших полушарий млекопитающих или плаща мозга низших хордовых.
Таламус играет важную роль в регуляции уровня сознания, процессов сна и бодрствования, концентрации внимания.