1.Кто работал?-В мастерской работали:мастер, подмастерье, работник.
На мануфактуре-рабочие.
2.В мастерской не было разделения труда, в мануфактуре напротив оно было.
3.В случае мастерской товар принадлежал тем, кто его сделал(мастер), а в мануфактуре товар принадлежал буржуа.
4.В мастерской товар производился для самих себя или на торговлю(по разному) . В мануфактуре весь товар шёл в розничную торговлю(в магазины. Можно написать просто: на продажу).