Насчет того, что "ВСЕГДА" это неверно. Ведь есть другие типы алелльных взаимодействий, когда доминантный аллель не полностью подавляет рецессивный. Например, неполное доминнирование (рис1), тогда только два доминантных аллеля смогут полностью подавить рецессивный, а в гетерозиготе лишь частично проявится доминантный.
Насчет транскрипции.
Думаю рецессивный аллель не транскрибируются, т.к. та, часть ДНК, где он наъодится сильно спирализована, т.е. является гетерохроматином, а оттого транскрипция не идет.