Емкость конденсатора:
C₁ = ε·ε₀·S/d₁
Энергия конденсатора:
W₁ = C₁·U²/2 = ε·ε₀·S·U²/(2·d₁)
Увеличим расстояние между обкладками в 2 раза:
d₂ = 2·d₁
Тогда
C₂ = ε·ε₀·S/(2·d₁)
W₂ = C₂·U²/2 = ε·ε₀·S·U²/(4·d₁)
Находим отношение:
W₂ / W₁ = 2·d₁ / (4·d₁) = 1/2
Действительно, энергия УМЕНЬШИЛАСЬ в 2 раза.
Ваша ошибка в том, что Вы использовали не ту формулу.
Заряд не остается постоянным... Постоянным является НАПРЯЖЕНИЕ на конденсаторе (U), так как источник ВКЛЮЧЕН!