Круговорот веществ никогда не бывает полностью замкнутым. Часть органических и неорганических веществ выносится за пределы экосистемы, и в то же время их запасы могут пополняться притоком извне.В отдельных случаях степень повторяющегося воспроизводства повторяющихся циклов круговорота веществ достигает 90 - 98%. Неполная замкнутость циклов в масштабах геологического времени приводит к накоплению элементов в различных природных сферах Земли. так накапливаются полезные ископаемые.