Большинство гидроксидов является приповерхностными минералами, которые образуются при процессах выветривания разных пород и руд, в процессе осадконакопления и диагенеза. Наиболее распространены среди них – гидроксиды железа, на долю которых приходится около 0,2 % от объема земной коры, и марганца. Большинство входящих в гидроксиды химических элементов являются металлами четвертого периода таблицы Д. И. Менделеева (алюминий, уран, марганец, железо, магний, медь, ванадий и др.), образующими с гидроксил-ионами устойчивые при низких температурах и труднорастворимые в воде химические соединения.
Практическое значение имеют гидроксиды железа, марганца, алюминия, урана, бора в качестве руд на эти элементы.