Внутренние воды представлены реками, озерами, в том числе искусственными озерами — водохранилищами и прудами, подземными, в том числе грунтовыми, водами, болотами, многолетней мерзлотой и ледниками. Внутренние воды теснейшим образом связаны с климатом . В известной степени все они — продукт климата, хотя, безусловно, зависят от других компонентов природы и влияют на них.
Взаимосвязи между климатом и внутренними водами хорошо отражает водный баланс. Он показывает соотношение осадков, испарения и стока (поверхностного и подземного) . Для России в целом водный баланс может быть представлен в следующем виде: ежегодно на территорию страны выпадает 9648 км2 осадков (564 мм слоя) , испаряется с поверхности 5605 км2 (327 мм) , стекает — 4043 км2 (237 мм) . На долю поверхностного стока приходится 3122 км2 (183 мм) , подземного — 921 км2 (54 мм) . Анализ водного баланса показывает, что в целом по стране около 42% атмосферных осадков стекает с поверхности и выносится в моря и внутренние водоемы.
Структура водного баланса изменяется не только от места к месту, но и во времени, что связано с колебаниями климата, т. е. со значительной межгодовой и межсезонной изменчивостью погоды и количества осадков, а также с хозяйственной деятельностью человека. Временные изменения отражаются прежде всего на малых реках, ледниках и озерах.
Одной из составляющих водного баланса является сток — важнейший природный процесс. Посредством стока осуществляются горизонтальные связи между ПТК. На сток влияет не только климат, но и рельеф (абсолютная и относительная высота, наклон поверхности, экспозиция склона, форма рельефа) , состав грунтов и почв, растительность и др. Каждый из компонентов изменяется в пространстве, поэтому и для стока характерно большое пространственное изменение в пределах России. Сток измеряется в абсолютных величинах — слой стока (в мм) , модуль стока (в л/сек · км2) — либо в относительных — коэффициент стока, отражающий отношение слоя стока к осадкам.
Использование показателя "слой стока" наиболее удобно при сравнении стока с другими составляющими водного баланса, прежде всего с осадками. Коэффициент стока высок прежде всего там, где из-за низких температур или поступления влагонасыщенного воздуха мало испарение. Величина стока в значительной мере определяет распределение внутренних вод по территории страны. В наибольшей степени сток влияет на густоту речной сети и водность рек.