Я понимаю выражение "В каждом гадком утёнке живёт прекрасный лебедь" так: что в каждом человеке, который не совсем красивый есть что-то хорошее, он может помочь в трудную минуту или выручить.
Поэтому и говорят: "Внешность обманчива".
Также существует пословица: "Некрасив собою, зато честен душою.".