1. Папоротники - сосудистые растения, а у плаунов листья укороченные и стелятся по земле.
2. У папоротников споры лежат на нижней стороне листа, а у плаунов споры развиваются в колосках.
3. У папоротников корни представлены корневищем и придаточными корнями, а у плаунов только придаточные корни, отходящие от побега.