3) Облака над морем потемнели, и повеяло прохладой.
Облака потемнели, а повеяло прохладой.
Облака и потемнели множественное число, повеяло единственное.
Повеяло не относится ко слову "облака"
Не знаю как ещё объяснить, но облака потемнели, а потом повеяло, само повеяло. Облака тут тип ни причем