Оформленное ядро с ядрышком - хранилище генетического материала, имеются мембранные (одно- и двумембранные) органоиды в отличие от прокариот (митохондрии, пластиды у растений, лизосомы, комплекс Гольджи), имеются мембраны в которых есть стеролы (у прокариот нет), но зато нет пептидогликана как у бактерий, тип рибосом 80S и архейный набор рибосомальных белков