Атом- мельчайшая химически неделимая частица ; атомы составляют химические элементы;
молекула же, это электрически нейтральная частица , состоящая из двух или более атомов ,связанных ковалентной связью; молекулы определяют физические свойства вещества;состав молекул выражается химическими формулами;
в физике же существует понятие как одноатомная молекула , т.е. атом
это и выражает схожесть понятия атом и молекула