Если по атласу, то рисуешь там линию. потом на миллиметровке или листике в клеточку рисуешь горизонтальную и вертикальную оси. по вертикальной будешь отлаживать высоту над уровнем моря (в атласе по цвету смотришь), по горизонтальной - линию свою,которую нарисовал (можно даже ее приложить). не забывая о масштабах(если линия маленькая, то можно все расстояния в профиле увеличить,тогда масштаб уменьшится). рисуешь точки высот по своей линии...и потом соединяешь их.