Горы опоясывают равнины с восточной и южной сторон. На севере Средней Азии расположен Казахский мелкосопочник, большая часть его разрушилась и превратилась в холмистую равнину. Лишь изредка в его центральной части встречаются холмы.
В восточной части Казахстана разместились отдельные хребты Чингизтау, Тарбагатай и Джунгарский Алатау.
В восточной части Средней Азии находится самая крупная в этом регионе горная система - Тянь-Шань. Самая высокая ее часть - массив Хан-Тенгри (пик Победы - 7439 м) - покрыта ледниками. Горы Тянь-Шаня делятся на северную, центральную, западную и южную части.
Горы Памир расположены на юге страны. Самая высокая их точка - пик Самани находится на высоте 7495 м над уровнем моря. Самые высокие вершины гор покрыты ледниками и вечными снегами. Самый большой ледник Средней Азии (ледник Федченко) расположен именно в этих местах. На юге Памира с северо-востока на юго-запад тянутся горы Гиндукуш.
Южная часть Средней Азии окаймлена цепью Туркмено-Хорасанских гор (Копетдаг, Нишапур, Банди-Туркестан, Сафедкох, Паропамыз). В этих горах в результате ветровой и водной эрозии образовались причудливые формы рельефа.