Кровеносная система. имеется хорошо развитое сердце, сокращения которого обеспечивают циркуляцию крови по организму. Сердце расположено позади последней пары жаберных мешков и отграничено от лежащей за ним печени околосердечным хрящом. Сердце миноги двухкамерное: оно состоит из одного предсердия и одного желудочка, а сзади них расположена венозная пазуха. Венозная кровь по венам поступает в венозную пазуху, оттуда переходит в предсердие и затем в желудочек. От желудочка отходит мощный артериальный стеол — брюшная аорта разветвляющаяся на приносящие жаберные артерии, по которым венозная кровь поступает в капилляры складок жаберных мешков. Окисленная (артериальная) кровь по выносящим жаберным артериям собирается в непарную спинную аорту и по ее ответвлениям разносится по всему телу.
Мочеполовая система. Органами выделения круглоротых служат мезонефрические (туловищные) почки которые в виде парных лентовидных образований подвешены на брыжейке к дорзальной стенке задней половины полости тела. По нижнему краю почек проходит тонкий канал - мочеточник.
Половые железы непарные, свободно занимают почти всю часть тела.