Правительство раскололо ряды своих противников и получило возможность
провести репрессии по отношению к вожакам и наиболее активным участникам
восстания, многие из которых были казнены 3 июля. 22 октября Морозов
вернулся в Москву и вновь возглавил правительство. Волнения в Москве продолжались до февраля 1649 года.