Якщо у тебе зерна - однина, Р. в., тоді перевірне слово зерна - множина, Н. в.
Зерна ( варіант однини, Р. в.) - наголос на а і ми не чуємо - писати и чи е.
У той самий час, у слові зерна ( варіант множини, Н. в.) наголос падає на е і ми чітко чуємо, що треба писати е.