Когда поезд входит в тоннель, он создаёт два пространства с разным давлением. Перед носом поезда-поршня давление повышается, а уже там, где начинается первый вагон давление падает - воздух становится разреженным. Именно в разреженном воздухе оказывается человек! Так как человек попадает в тоннель после поезда-поршня! А внутреннее давление в ушах человека не успевает адаптироваться к разреженному пространству, вот и возникает эффект "закладывания ушей".
Точно так же и при подъёме самолёта! С каждым новым метром поднятия на высоту воздух становится более разреженным, и так же "закладываются" уши...
Но уши могут "закладываться и при увеличении давления (плотности) воздуха. Спуск на глубину моря и спуск самолёта.
Поэтому простой ответ - "из-за перепада давления" - тоже можно считать правильным.