Буквы е, ё, ю, я после согласных в слове обозначают один звук: [э], [о], [у], [а] и указывают на мягкость этого согласного: семя — [с'э'м'а].
В остальных случаях (в начале слова, после гласных и после разделительных ъ и ь) буквы е, ё, ю, я обозначают два звука: [йэ], [йо], [йу], [йа] — судья [суд'йа]. Поэтому количество букв и звуков в словах не всегда одинаковое.
Буква Й - всегда мягкая и звонкая. Является вторым звуком букв е,ю,я.