Воздух состоит из нескольких газов: кислорода, озона, водорода, азота и т д, поэтому не совсем корректно говорить "молекулы воздуха", потому что это не чистое вещество.
Вода состоит из молекул, а не из атомов
Молекулы соли образуют кристаллическую решетку, которую нельзя рассматривать как соединение отдельных молекул и только, потому что многие свойства соли обусловлены коллективным взаимодейстием молекул в решетке
Почти то же самое касается алмаза. Он состоит из атомов углерода, соединенных в решетку